目录
　　
　　
　　
　　
　　
第1章  数据预处理    1
1.1  异常值的常见处理方法    1
1.2  缺失值填补的SPSS软件实现    8
1.3  缺失值填补的R软件实现    12

第2章  多元线性回归分析    17
2.1  多元线性回归的概念    17
2.2  多元线性回归的模型结构    17
2.3  多元逐步线性回归    20

第3章  Logistic回归分析    25
3.1  Logistic回归分析的基本概念    25
3.2  Logistic回归的模型结构    25
3.3  应用实例1：一般资料的Logistic回归    26
3.4  应用实例2：列联表资料的Logistic回归    29
3.5  应用实例3：多项Logistic回归分析    31
3.6  Logistic回归模型的Nomogram图展示    34
3.7  多个Logistic回归模型评价的决策曲线分析法    38

第4章  非线性回归拟合分析    43
4.1  非线性回归基本概念    43
4.2  应用实例1：对新增SARS病例数的预测分析    43
4.3  应用实例2：对累计SARS病例数的预测分析    48

第5章  生存分析    52
5.1  生存分析的基本概念    52
5.2  生存分析的资料特点    52
5.3  生存资料的分析方法    53
5.4  应用实例1：累积生存率的计算    53
5.5  应用实例2：小样本生存率的Kaplan-Meier估计    56
5.6  应用实例3：生存曲线比较的Log-rank检验    59
5.7  应用实例4：Cox回归    63
5.7.1  Cox模型结构与参数估计    64
5.7.2  应用实例：Cox回归分析    64
5.7.3  Cox回归的诺莫图绘制    67

第6章  基于竞争风险模型的生存分析    71
6.1  竞争风险模型    71
6.2  应用实例：竞争风险模型的生存分析    71

第7章  Meta分析    77
7.1  Meta分析概述    77
7.2  Meta分析的方法与步骤    77
7.3  应用实例1：二分类资料的Meta分析    78
7.4  应用实例2：连续资料的Meta分析    86

第8章  剂量-反应模型的Meta分析    91
8.1  剂量-反应关系的数据结构    91
8.2  线性拟合    92
8.3  非线性拟合-三次曲线拟合    94

第9章  决策树模型分析    96
9.1  分类的概念    96
9.2  分类的步骤    96
9.3  分类器性能的评估    97
9.4  决策树分类器简介    97
9.5  应用实例：决策树分类分析    99
9.6  应用实例：决策树回归分析    102

第10章  随机森林法提取特征属性    105
10.1  随机森林方法基本概念    105
10.2  基于平均基尼指数减少量的特征属性选择    105
10.3  应用实例：随机森林法提取特征属性    107

第11章  倾向性得分匹配方法    113
11.1  倾向性得分匹配方法概述    113
11.2  倾向性得分匹配方法的步骤    113
11.3  应用实例：倾向性得分匹配    114

第12章  用广义估计方程分析重复测量的定性资料    121
12.1  广义估计方程的基本概念    121
12.2  广义线性模型的结构    121
12.3  GEE算法    122
12.4  应用实例1：重复测量的实验数据    123
12.5  应用实例2：问卷调查中的多选题数据    124

第13章  基于支持向量机的微阵列数据分类    128
13.1  支持向量机简介    128
13.2  支持向量机的基本原理    128
13.3  应用实例：支持向量机分类    130

第14章  时间序列分析    132
14.1  时间序列分析的基本概念    132
14.2  时间序列分析的主要步骤    132
14.3  应用实例：时间序列分析    133

第15章  路径图分析    138
15.1  路径图分析基本理论    138
15.2  路径图分析的基本步骤    138
15.3  应用实例：路径图分析    139
15.3.1  第一个回归分析    139
15.3.2  第二个回归分析    141
15.3.3  第三个回归分析    142

第16章  主成分分析与因子分析    144
16.1  主成分分析概念    144
16.2  应用实例1：主成分分析    144
16.3  因子分析概念    151
16.4  应用实例2：因子分析    151

第17章  判别分析    156
17.1  判别分析的概念    156
17.2  常用的判别分析方法    156
17.3  判别函数的验证    157
17.4  应用实例：判别分析    157

第18章  聚类分析    166
18.1  聚类分析的概念    166
18.2  K均值聚类法    166
18.3  应用实例1：K均值聚类及可视化    167
18.4  系统聚类法    170
18.5  应用实例2：系统聚类    172
18.6  绘制双向聚类热图    177

第19章  关联规则    180
19.1  关联规则的基本概念    180
19.2  关联规则的质量和重要性    180
19.3  关联规则分析的基本方法    181
19.4  应用实例：关联规则分析    181

第20章  两组ROC曲线下的面积比较    185
20.1  ROC曲线的构建    185
20.2  ROC曲线下面积    186
20.3  两组ROC曲线下面积比较    186
20.4  应用实例：两组ROC曲线下面积比较    186
20.5  偏AUC分析    189

第21章  诊断准确性试验Meta分析    193
21.1  诊断准确性试验Meta分析基本概念    193
21.2  诊断准确性试验Meta分析的相关评价指标    193
21.3  应用实例：诊断准确性试验Meta分析    194

第22章  网络Meta分析    199
22.1  网络Meta分析的概念    199
22.2  基于经典频率派方法的网络Meta分析    200
22.3  基于贝叶斯方法的网络Meta分析    207

第23章  贝叶斯网络分析    216
23.1  贝叶斯网络的概念    216
23.2  应用实例：贝叶斯网络构建    217

第24章  偏最小二乘回归与判别分析    222
24.1  偏最小二乘回归的基本步骤和原理    222
24.2  应用实例：偏最小二乘回归分析    223
24.3  偏最小二乘判别分析    226

第25章  Lasso回归分析    233
25.1  基于Lasso方法的线性回归模型    234
25.2  基于Lasso方法的Logistic回归模型    237
25.3  基于Lasso方法的Cox回归模型    241

参考文献    244
　　
VIII
医学数据挖掘案例与实践（第2版）
　　
IX
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