目录
第1章绪论1
1.1引言1
1.2全比较问题及全比对数据分发问题的形式化描述3
1.3全比较问题研究动态6
1.4基因组序列比对大数据分发模型研究现状10
1.5大数据计算技术13
1.6本章小结21
参考文献22
第2章基于整数规划的基因组序列比对大数据分发模型30
2.1文件分发模型的构建30
2.2文件分发算法设计33
2.3实验设计与结果分析36
2.4模型优化与改进 41
2.5全量分发、Hadoop分发和文件分发模型比较实验 54
2.6本章小结 61
参考文献61
第3章基于启发式的基因组序列比对大数据分发模型63
3.1文件分发模型的构建63
3.2文件分发算法设计71
3.3实验设计与实验结果分析80
3.4模型优化与改进88
3.5本章小结98
参考文献98
第4章基于粒子群优化的全比较计算数据分发策略101
4.1引言101
4.2全比较计算相关研究102
4.3DDBPSO模型相关算法设计107
4.4相关实验与结果分析115
4.5本章小结125
参考文献125
第5章文件切分方案评价模型研究与构建128
5.1文件切分方案评价指标体系的建立 128
5.2利用层次分析法建立文件切分模型 130
5.3文件切分最优个数的确定 135
5.4文件切分算法设计 138
5.5文件合并算法 141
5.6本章小结 143
参考文献144
第6章面向全比较问题的分布式文件分发框架构建145
6.1分布式文件分发框架结构设计145
6.2文件分发策略计算 146
6.3文件传输 149
6.4系统实现 150
6.5相关实验 153
6.6本章小结168
参考文献 168